Protein–RNA interactions for Protein: O60240

PLIN1, Perilipin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN1O60240 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PLIN1O60240 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms