Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
PRICKLE3O43900 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PRICKLE3O43900 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms