Protein–RNA interactions for Protein: O43896

KIF1C, Kinesin-like protein KIF1C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF1CO43896 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
KIF1CO43896 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
KIF1CO43896 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms