Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ATP9BO43861 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
ATP9BO43861 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms