Protein–RNA interactions for Protein: O43805

SSNA1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSNA1O43805 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SSNA1O43805 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSNA1O43805 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms