Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
E2F3O00716 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
E2F3O00716 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F3O00716 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F3O00716 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F3O00716 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
E2F3O00716 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
E2F3O00716 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
E2F3O00716 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms