Protein–RNA interactions for Protein: B4DGG1

cDNA FLJ60496, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DGG1 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
B4DGG1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
B4DGG1 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
B4DGG1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
B4DGG1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
B4DGG1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
B4DGG1 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms