Protein–RNA interactions for Protein: B0YJ81

HACD1, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD1B0YJ81 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
HACD1B0YJ81 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
HACD1B0YJ81 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms