Protein–RNA interactions for Protein: A6NNY8

USP27X, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP27XA6NNY8 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
USP27XA6NNY8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
USP27XA6NNY8 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
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