Protein–RNA interactions for Protein: A6NIN4

Putative uncharacterized protein FLJ38447, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A6NIN4 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NIN4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
A6NIN4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
A6NIN4 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
A6NIN4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
A6NIN4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
A6NIN4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
A6NIN4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
A6NIN4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms