Protein–RNA interactions for Protein: A6NEM1

GOLGA6L9, Golgin subfamily A member 6-like protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L9A6NEM1 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GOLGA6L9A6NEM1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GOLGA6L9A6NEM1 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms