Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MEIS3P1A6NDR6 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms