Protein–RNA interactions for Protein: A4D0V7

CPED1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPED1A4D0V7 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CPED1A4D0V7 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms