Protein–RNA interactions for Protein: A1A4Y4

IRGM, Immunity-related GTPase family M protein, humanhuman

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRGMA1A4Y4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
IRGMA1A4Y4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
IRGMA1A4Y4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms