Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
E2F8A0AVK6 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
E2F8A0AVK6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms