Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC008079.2-201ENST00000623543 20396 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZC3H12B-201ENST00000338957 7256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RNU7-174P-201ENST00000516248 59 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 U4.4-201ENST00000620626 117 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPN13-209ENST00000511467 8076 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 POSTN-203ENST00000379747 3373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 GHR-208ENST00000612382 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PHACTR2-207ENST00000427704 9531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TMEM154-201ENST00000304385 10698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 OR5A1-202ENST00000641045 8612 ntAPPRIS P1 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SV2B-201ENST00000330276 11202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MYO9A-203ENST00000444904 7749 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SCN1A-201ENST00000303395 8533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA40B-201ENST00000385573 128 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MBNL1-218ENST00000485910 4257 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TC2N-203ENST00000435962 5146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ZNF445-201ENST00000396077 18299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-227ENST00000614895 9249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC1.7□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CKAP5-202ENST00000354558 6428 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORA41B-201ENST00000384785 128 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 KAT6B-201ENST00000287239 8287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 MACF1-232ENST00000567887 24319 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX5L-202ENST00000392649 8540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP8-202ENST00000396444 19026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 CCSAP-202ENST00000366686 4399 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 VCAN-203ENST00000343200 9455 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
KRTAP9-3Q9BYQ3 PTPRB-202ENST00000334414 12316 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
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