Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6C7

LINC00312, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00312, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00312Q9Y6C7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 AC093525.10-201ENST00000625130 1569 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
LINC00312Q9Y6C7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
LINC00312Q9Y6C7 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms