Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y679

AUP1, Ancient ubiquitous protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AUP1Q9Y679 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
AUP1Q9Y679 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms