Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Q9

GTF3C3, General transcription factor 3C polypeptide 3, humanhuman

Predictions only

Length 886 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C3Q9Y5Q9 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GTF3C3Q9Y5Q9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms