Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TRAF6Q9Y4K3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TRAF6Q9Y4K3 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms