Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B6

DCAF1, DDB1- and CUL4-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF1Q9Y4B6 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
DCAF1Q9Y4B6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
DCAF1Q9Y4B6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms