Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3S2

ZNF330, Zinc finger protein 330, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF330Q9Y3S2 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ZNF330Q9Y3S2 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ZNF330Q9Y3S2 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms