Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PRELID3BQ9Y3B1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PRELID3BQ9Y3B1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms