Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2Y8

PRG3, Proteoglycan 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG3Q9Y2Y8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PRG3Q9Y2Y8 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms