Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y296

TRAPPC4, Trafficking protein particle complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC4Q9Y296 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TRAPPC4Q9Y296 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRAPPC4Q9Y296 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms