Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y251

HPSE, Heparanase, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPSEQ9Y251 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
HPSEQ9Y251 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HPSEQ9Y251 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms