Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y235

APOBEC2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC2Q9Y235 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
APOBEC2Q9Y235 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.3 ms