Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IGSF9BQ9UPX0 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IGSF9BQ9UPX0 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.7 ms