Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC6

PADI1, Protein-arginine deiminase type-1, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI1Q9ULC6 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
PADI1Q9ULC6 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
PADI1Q9ULC6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms