Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAB23Q9ULC3 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAB23Q9ULC3 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.9 ms