Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKG9

CROT, Peroxisomal carnitine O-octanoyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CROTQ9UKG9 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CROTQ9UKG9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
CROTQ9UKG9 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms