Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK99

FBXO3, F-box only protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO3Q9UK99 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FBXO3Q9UK99 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms