Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJT0

TUBE1, Tubulin epsilon chain, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBE1Q9UJT0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TUBE1Q9UJT0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TUBE1Q9UJT0 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms