Protein–RNA interactions for Protein: Q9UH90

FBXO40, F-box only protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO40Q9UH90 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
FBXO40Q9UH90 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NAPSB-203ENST00000531692 561 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FBXO40Q9UH90 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms