Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
DKK2Q9UBU2 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
DKK2Q9UBU2 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms