Protein–RNA interactions for Protein: Q9P267

MBD5, Methyl-CpG-binding domain protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD5Q9P267 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
MBD5Q9P267 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MBD5Q9P267 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms