Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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COL20A1Q9P218 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
COL20A1Q9P218 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms