Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1Z3

HCN3, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 3, humanhuman

Predictions only

Length 774 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN3Q9P1Z3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
HCN3Q9P1Z3 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
HCN3Q9P1Z3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms