Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR4

VSX1, Visual system homeobox 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX1Q9NZR4 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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VSX1Q9NZR4 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
VSX1Q9NZR4 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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