Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
KCNIP1Q9NZI2 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms