Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOXC10Q9NYD6 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
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