Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY46

SCN3A, Sodium channel protein type 3 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN3AQ9NY46 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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SCN3AQ9NY46 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
SCN3AQ9NY46 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
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