Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXN4

GDAP2, Ganglioside-induced differentiation-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDAP2Q9NXN4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
GDAP2Q9NXN4 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms