Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX63

CHCHD3, MICOS complex subunit MIC19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD3Q9NX63 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CHCHD3Q9NX63 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms