Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSB4

KRT82, Keratin, type II cuticular Hb2, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT82Q9NSB4 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
KRT82Q9NSB4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms