Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS93

TM7SF3, Transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3Q9NS93 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TM7SF3Q9NS93 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms