Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB8

GPCPD1, Glycerophosphocholine phosphodiesterase GPCPD1, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPCPD1Q9NPB8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
GPCPD1Q9NPB8 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
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