Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RAB9BQ9NP90 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
RAB9BQ9NP90 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms