Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SYNCQ9H7C4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms