Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CCSER1Q9C0I3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCSER1Q9C0I3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
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